Dobrý den,
zda existuje přímo nějaký program, to netuším. To by mohli vědět nějací profíci grafici.
Ale trochu nouzově by se to dalo udělat v nějakém běžném programu na úpravu fotek, který umí ořezávat myší s pomocí kurzoru (třeba Zoner Photo Studio nebo PhotoScape). Stačí vytvořit pole ořezu části fotky, kde znám přesný rozměr a přečíst si rozměr v pixelech, pak totéž udělat tam, kde potřebuji rozměr změřit a přepočítat si to.
Ale v závislosti na použitém objektivu nelze očekávat úplnou přesnost zejména v okrajích fotky, zvlášť u širokoúhlých objektivů a u teleobjektivů.